Sabías que los nativos americanos estuvieron presentes en la Baja Florida hace 10,000 años?
Cuando?...cuando los niveles oceánicos eran bajos y Biscayne Bay estaba comparativamente vacía de agua.
Pues los niveles de agua aumentaron hace unos 4,000 años e inundaron la bahía. Los arqueólogos creen que cualquier rastro dejado por los pueblos de esa época está ahora sumergido; ninguno ahora existe en tierras secas en el parque. El Sitio Fósil Cutler, justo al oeste del parque, ha dado evidencia de la ocupación humana que se extiende por lo menos hasta 10,000 años antes del presente. La evidencia más temprana de la presencia humana en Biscayne data de aproximadamente 2,500 años antes del presente, con montones de conchas y conchas de tiza dejadas por la cultura Glades. La cultura Glades fue seguida por la gente de Tequesta, que ocupó las costas de la Bahía de Biscayne. Los Tequesta eran una comunidad sedentaria que vivía de peces y otras especies marinas, sin actividad agrícola significativa. Un sitio en Sands Key ha arrojado fragmentos de cerámica, conchas trabajadas y otros artefactos que indican ocupación desde al más reciente 1,000 DC hasta alrededor de 1,650, después del contacto con los europeos.
Se han identificado un total de cincuenta sitios arqueológicos significativos en el parque.